在离线状态下管理避难所的核心在于优化资源分配与预判潜在风险。首先要确保电力、食物和水三大基础资源的产能与库存平衡，建议优先升级三联生产房间并配备对应高属性居民，例如力量(S)高的居民更适合发电厂，感知(P)高的居民适合净水室。离线期间生产虽会继续，但资源消耗速度不变，因此需提前储备至少8小时的用量以防突发灾难。同时将闲置居民调至训练室提升属性，尤其是耐力(E)和运气(L)，前者影响探险生存能力，后者增加资源采集效率。灾难应对方面，每个房间必须常驻满员且配备武器，最低攻击力建议达到4以上以快速消灭蟑螂或火灾。
探索废土是离线期间获取额外资源的重要途径，但需严格把控外出居民的装备与药品配置。派遣前应为其装备高伤害武器和+E属性的服装，携带治疗针与消辐宁的比例建议为3:1，依据探险时长动态调整。居民在废土的探索进度会持续累积，但死亡后需消耗瓶盖复活，因此E属性≥10的居民更适合长期探险。若避难所出现资源危机，可紧急召回探险队携带物资支援，但需承担往返时间成本。
火灾、蟑螂和强盗入侵的强度与房间等级成正比，因此高层级房间需部署更多战力。大门后方建议建造6人大型武器厂作为防御缓冲区，全员配备攻击力≥6的武器以抵御入侵。灾难蔓延机制要求玩家必须保持房间人员常驻，空房间会加速灾害扩散。若发现离线回归后存在未处理的尸体，需立即清理以避免全体居民幸福度持续下降，可通过集中调配高魅力(C)居民至广播站快速恢复情绪值。
广播站在离线时仍会缓慢吸引新居民，但过度增长可能导致资源短缺。建议将人口控制在当前建筑容量70%左右，并通过宿舍控制生育节奏。孕妇与儿童无法参与灾难应对，因此离线期间应避免大规模生育行为。若需精简人口，可将低属性居民驱逐至废土，但需注意其携带的装备无法自动回收。宠物分配方面，优先将增加生产速度的宠物部署在资源房间，探险加速宠物则固定配给外派主力。
巧手先生应部署在深层资源区自动收集物资，避免参与战斗导致高额复活费用。房间合并与升级会提高效率，但需预留足够瓶盖应对突发修复需求。记忆保管库可离线积累瓶盖奖励，但副本进度不会自动推进。最后建议保持至少2个医疗站和科学实验室的库存上限，确保回归后能快速处理辐射疾病与重伤员。
